曾生活在印度洋小岛上的一种已灭绝老鼠可能会让科学家复活更著名灭绝动物——如猛犸象的梦想彻底破灭。圣诞岛大鼠在 100 多年前消失,研究人员现在表示,
即使是其最详细的基因组也不够完整,无法让它复活。未参与研究的加州大学圣巴巴拉分校生态学家 Douglas McCauley表 示,这项工作展示了科学家距离通过对近亲基因进行改造复活已灭绝的物种“是多么接近——但又仍然是多么毁灭性的遥远”。为了让一个已灭绝物种复活,科学家首先需要对其基因组进行测序,然后编辑一个活的近亲物种的 DNA 匹配它。接下来的挑战是用修改后的基因组制造胚胎、并将它们植入活体代孕母体。到目前为止,科学家已对大约 20 种灭绝物种的基因组进行了测序,其中包括洞熊、旅鸽以及几种猛犸象和恐鸟。目前还没有人报告在活体亲缘物种中重新创造出已灭绝基因组。
在新研究中,哥本哈根大学的演化遗传学家 Tom Gilbert 认为最好从小处着手。他推理道:“如果我们想尝试如此疯狂的事情,为什么不从一个简单的模型开始?”因此,他与汕头大学的分子生物学家林剑青及同事将注意力放在圣诞岛大鼠(Rattus macleari)身上,这种老鼠于 1908 年从位于澳大利亚以西约 1200 公里处的小岛上消失。McCauley 表示,鉴于它与褐家鼠的密切关系,该物种“应该是一个梦幻般的‘去灭绝’(译注,又称物种复活)候选者,”褐家鼠是一种经过充分研究的实验室动物,具有完整的基因组序列,科学家已知道如何修改基因组序列。
Gilbert 和 Lin 从两只保存完好的圣诞岛大鼠的皮肤上提取了 DNA,对其进行多次测序,获得尽可能多的基因组。他们做了 60 多次测序。古老的 DNA 只能以小片段的形式存在,因此团队使用褐家鼠的基因组作为参考,以尽可能多地拼凑已绝迹鼠的基因组。Lin、Gilbert和他们的同事在《当代生物学》上
报告称,比较这两种基因组发现,圣诞岛大鼠的基因组仍有 5% 的缺失。估计这种老鼠有 3.4 万个基因,丢失的序列大约有 2500 个。Gilbert 表示:“我很惊讶。”比如找回的 DNA 包括圣诞岛大鼠特有的圆耳基因,但是重要的免疫系统和嗅觉基因要么缺失,要么不完整。伦敦自然历史博物馆的演化生物学家 Victoria Herridge 表示,这项工作“确实凸显出(去灭绝)工作的困难,甚至可能是荒谬的。”Herridge 表示,很多缺失的基因让每个物种都独一无二。值得注意的是,人类和黑猩猩以及倭黑猩猩的基因组差异只有1%。